打败熊霸之后，兔二（黄磊配音）被视为打败邪恶和维护正义的保护者而受到人们膜拜。被突如其来的声望冲昏头脑的兔二不再苦练武功，一心要行走江湖行侠仗义。某一天，兔二在河边救了玄火教的一位长老展天（王劲松配音

该片讲述了小兔侠在功夫学校中的校园生活。学校坐落在京城附近的功夫山上，校长为德高望重的功夫大师--白猿，学校里有“天字班”和“地字班”，两个班级性格各异的学生互相竞争、学习知识、共同成长。

兔二、玄影等功夫学校的小伙伴们每天在学校里开心的练武，快乐的生活。突然有一天，功夫学校对面一夜之间冒出一家充满科技感的“神府学校”，吸引了大批小朋友去报名。于是，两家学校就开始了一场“传统”与“科技”