——虽然很突然，但世界已经灭亡了。1000年前一度毁灭的地球，由名为“Y”的传说中的时钟技师以时钟装置再构筑而成的世界。吊车尾高中生·见浦直人，与“Y”所留下的自动人偶琉珠，以及天才时钟技师少女·玛丽

和我们一起，继续成长的物语。阿良良木历的物语结束了。以地狱般的春假为开端，历经各种因缘际会，阿良良木历高中生活最后的一年结束了——原本是这么想的。但就在毕业典礼结束的第二天早晨，发生了意想不到的事态。